Le LMI-ELDORADO s’organise autour 3 équipes verticales, centrées sur un modèle d’étude (vecteurs, vertébrés et humains) ainsi que de 8 équipes transversales qui abordent des aspects plus techniques. Chacunes de ces équipes transversales a pour objectif l’animation scientifique à travers les 3 modèles d’études ainsi que la création de synergies entre les différents projets.