UC MEXUS-CONACYT. Analyse métagénomique virale dans les réservoirs sylvatiques et les vecteurs des zones tropicales à haute diversité biologique au Mexique

L’augmentation des maladies émergentes et réémergentes causées par des agents pathogènes viraux a récemment été associée à des réservoirs non humains, et les maladies zoonotiques représentent 30% de celles qui affectent les humains. Les stratégies d’étude des agents pathogènes émergents doivent avoir une approche globale et être considérées dans le cadre du concept de « une santé ». Parmi les réservoirs signalés, les rongeurs, les chauves-souris et les oiseaux ont été fortement associés à des maladies telles que le hantavirus, la fièvre de Lassa, la grippe et le virus du Nil occidental. De plus, les moustiques sont considérés comme des vecteurs de maladies telles que le Zika et la Dengue. Le Mexique est considéré comme un pays « mégadivers » avec une grande diversité biologique et des conflits environnementaux importants qui peuvent représenter des zones similaires en Amérique. Il est important d’identifier les virus circulants et de surveiller les réservoirs pour déterminer leur importance dans la transmission de maladies. Dans cette étude, nous proposons de collecter des échantillons d’oiseaux, de chauves-souris, de rongeurs et de moustiques dans la péninsule du Yucatan. L’analyse NGS sera utilisée avec des oligonucléotides spécifiques pour enrichir les séquences virales afin de détecter la diversité virale dans les réservoirs forestiers. Les données des échantillons collectés seront analysées pour générer des modèles statistiques spatiaux, identifier les zones à risque et comprendre l’impact de la présence de réservoirs et de l’émergence de maladies infectieuses.